以全面提高质量为重点
更加注重提高人才培养质量、提升科学研究水平、增强社会服务能力，特别要求高等学校优化结构、办出特色。
建设现代大学制度
坚持和完善党委领导下的校长负责制，探索教授治学的有效途径，探索建立高等学校理事会或董事会，健全社会支持和监督学校发展的长效机制，推进产学研用相结合等。
公共资源配置在阳光下运行
在经费方面实行以举办者投入为主、受教育者合理分担培养成本、学校设立基金接受社会捐赠等多渠道筹措经费的投入机制。加强经费管理，明确提出设立高等教育拨款咨询委员会，增强经费分配的科学性，在高校试行设立总会计师职务。公办高校总会计师由政府委派，目的就是要强化制度监督、社会监督和媒体监督，让高等教育领域公共资源配置在阳光下运行。
建立高校分类体系，避免同质化
高等教育结构更加合理，特色更加鲜明。建立高校分类体系，实行分类管理，引导高校合理定位，克服同质化倾向，不仅要继续加快建设一流大学和一流学科，推进重点学科建设创新，而且要引导其他各类高校在不同层次、不同领域办出特色，争创一流。
多项教育体制改革涉及高校
《规划纲要》文本的第三部分全面谋划了教育体制改革新思路新方向，更新人才培养观念、创新人才培养模式、改革教育质量评价和人才评价制度、考试招生制度改革等，都要在各类高等学校师生中形成更为广泛的共识和自觉行动。
